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세금생활

세금계산서 미발급하면 벌금? 과태료부터 세무조사까지

by infofi-1 2025. 6. 29.
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세금계산서 미발급하면 벌금? 과태료부터 세무조사까지

“한두 건쯤 괜찮겠지...”
바쁜 와중에 세금계산서를 깜빡 잊은 적, 다들 한 번쯤은 있으실 겁니다. 하지만 이 작은 실수가 과태료, 불이익, 심지어 세무조사로 이어질 수 있다는 사실 알고 계셨나요?

이번 글에서는 프리랜서와 1인 사업자, 일반 소상공인 모두가 반드시 알아야 할
세금계산서 미발급, 지연 발급 시 발생하는 불이익과 세무 리스크를 실제 사례와 함께 자세히 소개합니다.


세금계산서 발급 기한, 지키지 않으면 어떻게 되나요?

전자세금계산서는 무조건 ‘정해진 기한’ 내에 발급하고, 국세청에 전송해야 합니다.

구분세금계산서 발급 기한국세청 전송 기한
발급 공급일이 속한 달의 말일 기준 → 익월 10일까지 발급일 익일 자정까지
예: 5월 15일 거래 6월 10일까지 발급 발급한 날의 다음 날까지 전송
 

기한을 어기면 어떻게 될까요?


미발급, 지연발급, 허위발급 시 과태료는?

세법상, 공급자는 반드시 기한 내에 전자세금계산서를 발급하고 전송할 의무가 있습니다. 위반 시 과태료가 부과되며, 고의성이 있거나 반복적인 경우 세무조사 대상으로 분류될 수 있습니다.

위반 사례과태료부연 설명
아예 미발급 공급가액의 2% 금액이 클수록 과태료도 급증
기한 이후 지연 발급 공급가액의 1% (최대 2%) 신고불성실 가산세로 추가 부과 가능
전송은 했지만 지연됨 공급가액의 0.5%~1% 반복 시 가중
허위 세금계산서 발급 공급가액의 2~3배 조세포탈 혐의 가능, 형사처벌 대상
 

💡 예시: 800만 원짜리 세금계산서 누락 시 → 과태료 최대 16만 원
(단, 허위·고의 판단 시 1,600만 원 이상까지 올라갈 수 있음)


실제 사례로 보는 세무리스크

사례 1) ‘거래처가 발급 요청을 안 해서 그냥 넘어갔어요’

→ 거래처의 요청 여부와 관계없이, 일반과세자는 무조건 발급 의무가 있습니다.
과태료는 공급자(본인)에게 부과되며, 거래처가 나중에 문제 삼으면 소급 청구될 수도 있습니다.


사례 2) ‘매출 정리하다 보니 지난달 건을 깜빡했어요’

→ 기한이 지난 후 발급 시 수정세금계산서가 아닌 ‘지연 발급’으로 간주되며, 과태료 + 가산세 대상입니다.
특히 국세청은 반복적인 지연 건을 ‘의도적인 누락’으로 판단할 수 있어 주의가 필요합니다.


사례 3) ‘홈택스 오류로 전송이 안 됐어요’

→ 시스템 오류라도 발급자 책임입니다.
정상적으로 발급했더라도 국세청 전송까지 완료되어야 법적 효력이 발생합니다. 오류가 있다면 즉시 스크린샷·증빙 확보 후 고객센터나 세무대리인과 협의 필요합니다.


홈택스에서 발급 실수 시, 이런 대처가 필요합니다

실수 유형해결 방법
발급 날짜를 잘못 설정 홈택스에서 ‘발급 취소’ 후 재발급 가능. 단, 기한 내 조치 시 과태료 없음
거래처 정보 오기재 공급받는자 정보 수정 → 기존 문서 취소 → 재발급
전송만 누락됨 홈택스 → 전자세금계산서 관리 → 미전송건 수동 전송
 

실수 반복 시, 세무조사까지 이어질 수 있습니다

단순 과태료로 끝나는 경우도 있지만, 누락이 반복되거나 거래규모가 크다면
국세청의 데이터 분석 시스템(RIS)에 포착되어 비정상 거래자로 자동 분류될 수 있습니다.

국세청의 세무조사 사전 징후

  • 수개월 간 특정 사업자의 매출 누락
  • 세금계산서 발행 이력과 실제 매출 간 불일치
  • 수입금액 누락이 있는 종합소득세 신고

세금계산서는 국세청의 조사 알고리즘이 가장 민감하게 반응하는 항목 중 하나입니다.


자주 묻는 질문 (FAQ)

Q1. 간이과세자도 세금계산서 미발급 시 과태료가 있나요?
A. 원칙적으로 간이과세자는 발급 의무가 없으므로 과태료 부과 대상이 아닙니다.
다만 발급을 자발적으로 진행했을 경우에는 지연 발급 등에 대한 책임이 일부 발생할 수 있습니다.

Q2. 발급은 했는데 국세청 전송을 깜빡했습니다.
A. 발급과 국세청 전송은 별도입니다. 전송 누락 시에도 공급가액 1%의 과태료가 발생할 수 있으며, 미전송 건은 홈택스에서 반드시 수동 전송해야 합니다.

Q3. 몇 건 정도 누락하면 세무조사 대상이 되나요?
A. 정확한 기준은 비공개지만, 일반적으로 3건 이상 또는 1,000만 원 이상 누락이 반복되면 리스크가 높아지며, 다른 항목과 함께 위험사업자로 자동 분류될 가능성이 있습니다.


실무 체크리스트: 세금계산서 사고 예방 루틴 만들기

✅ [ ] 매출 발생 시 거래일자 기준으로 ‘발급 기한’ 캘린더에 등록
✅ [ ] 홈택스 자동전송 설정 + 발급 내역 매월 1회 점검
✅ [ ] 거래처로부터 사업자등록증 사본 수령 후 미리 저장
✅ [ ] 발급 전 공급가액·품목·공급받는자 이메일 이중 확인
✅ [ ] 월말에 발급 누락 점검용 엑셀 시트 운영


마무리: 과태료보다 무서운 건 "신뢰 하락"입니다

세금계산서 발급을 정확하게 관리한다는 건
단순히 과태료를 피하는 게 아니라,
거래처와의 신뢰, 세무 안전망, 사업 지속 가능성을 지키는 핵심입니다.

아무리 작은 금액이라도, 세금계산서 발급은 사업자의 의무이자 권리입니다.
매출이 잡히는 순간, 반드시 “세금계산서 어떻게 보내드릴까요?”를 기억하세요.


다음 글 예고

다음 4편에서는
현금영수증, 카드영수증, 세금계산서
어떤 증빙 방식이 가장 유리하게 비용처리되는지 비교 분석해드립니다.
소득세 줄이고 싶은 분이라면 꼭 보셔야 할 내용입니다.

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